Сибулиус вроде как считается лучшей программой на этом порище. Проигрывать можно также сразу. Легко переносить и редактировать из одного иснтрумента в другой, транспонировать, ставить автоматически аппдикатуру.
Сохраняется в своем формате, но можно сохранить в миди, в графических форматах, можно экспортировать миди и вроде даже распознавать сканы.